I contenuti della Casa della storia europea sono preparati da un gruppo di progetto interdisciplinare composto da esperti e storici di tutta Europa, sotto la guida della storica e curatrice Taja Vovk van Gaal.
Il consiglio direttivo sovrintende alla gestione generale del progetto e si avvale della consulenza di Harald Rømer, ex Segretario generale del Parlamento. È presieduto dall'ex Presidente del Parlamento europeo Hans-Gert Pöttering ed è composto da figure di alto livello del mondo politico e da rinomate personalità pubbliche, e riunisce al suo interno esponenti di diverse istituzioni europee e delle autorità di Bruxelles.
Il comitato accademico e composto da storici e professionisti di musei di fama internazionale, svolge un ruolo di controllo e consulenza su questioni storiche e di trascrizione museografica.
