As declarações de independência eslovena e croata conduziram a um conflito armado, que depois se alastrou à Bósnia-Herzegovina, onde os grupos étnicos se defrontaram. O genocídio e a limpeza étnica tornaram-se as marcas atrozes de uma guerra que terminou em 1995, com os Acordos de Paz de Dayton. O Presidente Milošević e os dirigentes militares sérvios viriam a utilizar de novo a limpeza étnica no Kosovo.