Declarațiile de independență ale Sloveniei și Croației au condus la un conflict armat care s-a extins ulterior în Bosnia și Herțegovina, unde au avut loc confruntări între grupurile etnice. Genocidul și epurarea etnică se numără printre atrocitățile care au caracterizat acest război, încheiat în 1995, în urma Acordului de pace de la Dayton. Președintele Serbiei, Milošević, și liderii militari au recurs din nou la epurarea etnică în Kosovo.