Vyhlásenia nezávislosti Slovinska a Chorvátska vyústili do ozbrojeného konfliktu, ktorý sa potom rozšíril do Bosny a Hercegoviny, kde došlo k zrážkam medzi etnickými skupinami. Táto strašná vojna, ktorú sprevádzala genocída a etnické čistky, sa skončila v roku 1995 Daytonskou mierovou dohodou. Srbský prezident Miloševič a vojenské vedenie neskôr znovu použili etnické čistky v Kosove.