Zaradi slovenske in hrvaške razglasitve samostojnosti je prišlo do oboroženega konflikta, ki se je nato razširil v Bosno in Hercegovino, kjer so se spopadle etnične skupine. Vojno, ki se je končala leta 1995 z daytonskim mirovnim sporazumom, sta strašljivo zaznamovala genocid in etnično čiščenje. Srbski predsednik Milošević in vojaško vodstvo sta nato etnično čiščenje ponovno izvajala na Kosovu.